Nama Inkubator	Lembaga Induk Inkubator	Provinsi
Inbis UNY	-	D.I. Yogyakarta
Pusat Inkubasi Kewirausahaan Universitas Muhamadiyah Yogyakarta	-	D.I. Yogyakarta
Inkubasi Bisnis & Inovasi Bersama (IBISMA) Universitas Islam Indonesia	-	D.I. Yogyakarta
Direktorat Pengembangan Usaha dan Inkubasi UGM, PT GAMA MULTI USAHA MANDIRI	-	D.I. Yogyakarta
IBT BBKKP Yogyakarta	-	D.I. Yogyakarta
Inkubator AMIKOM YOGYAKARTA	-	D.I. Yogyakarta
AIR KUBI UAD	-	D.I. Yogyakarta
IBT WIMAYA UPN Veteran Yogyakarta	-	D.I. Yogyakarta
DIIB UB	-	Jawa Timur
ILBI ITS	-	Jawa Timur